1、作用不同：厘清的后面主要是承接关系、原则，而理清的后面主要是承接思路、头绪。2、表示不同：厘清表示要清楚分辨什么是应该的什么是不应该的，而理清表示想问题时陷入了死胡同，需要先将自己的思路整理清楚。3、本质不同：厘清通常情况下是指的整理关系、原则及任务等，而理清则是表示理清头绪等有条有理的事物。
厘是极小的数量，清是清楚，两者合起来表示从最细小的方面都搞得条条有序清清楚楚了，因此可以引申出整理清楚的意思。
比如“厘清事实真相”这里的厘清，表示出的是查清楚的意思，如果将此处的厘清改为理清，这句话将会成为一个病句，所以理清只能用于一些有条有理的事物，比如理清头绪、思路等。
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